Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

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fr:impilopedia:genex:rnaseq:airway_project:fetching_raw_data [2026/05/28 14:09] – [Introduction] foisysfr:impilopedia:genex:rnaseq:airway_project:fetching_raw_data [2026/05/28 14:52] (Version actuelle) – [Introduction] foisys
Ligne 9: Ligne 9:
 <sxh bash> <sxh bash>
 % mkdir /shares/data/rnaseq % mkdir /shares/data/rnaseq
 +% mkdir /shares/data/rnaseq/airway
 </sxh> </sxh>
     * Nous savons (en lisant le papier associé) que les lignées ont subit l'un des traitements suivant: DMSO comme contrôle, albuterol, dexaméthasone ou albuterol+dexaméthasone. On crée alors une hiérarchie avec cette information:     * Nous savons (en lisant le papier associé) que les lignées ont subit l'un des traitements suivant: DMSO comme contrôle, albuterol, dexaméthasone ou albuterol+dexaméthasone. On crée alors une hiérarchie avec cette information:
 <sxh bash> <sxh bash>
-% cd /shares/data/rnaseq+% cd /shares/data/rnaseq/airway
 % mkdir dmso % mkdir dmso
 % mkdir alb % mkdir alb
Ligne 19: Ligne 20:
 </sxh> </sxh>
  
-  * Plus à venir...+  * Permissions: plus à venir... 
 + 
 +  * Dans le cas de l'analyse, le simple fait que chacun peut la faire selon ses propres hypothèses, on va plutôt mettre le tout dans notre répertoire ''$HOME'': 
 +<sxh bash> 
 +# On reste générique car le repertoire peut contenir 
 +# autre chose que des projets de transcriptomique... 
 +% mkdir $HOME/analysis 
 +% mkdir $HOME/analysis/rnaseq 
 +% cp -r /shares/data/rnaseq/airway $HOME/analysis/rnaseq 
 +</sxh>
    
 +  * Plus à venir...