Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- fr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:fastp_0241 [2025/05/15 16:27] – [Procédure] foisys
+++ fr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:fastp_0241 [2025/05/15 16:27] (Version actuelle) – [Installation de Fastp 0.24.0] foisys
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+====== Installation de Fastp 0.24.1 ======
+===== Libraries additionnelles =====
+Les librairies suivantes sont nécessaires afin de compiler Fastp avec succès:
+  * ''libdeflate-dev''
+  * ''libisal-dev''
+<sxh bash>
+% sudo apt install --no-install-recommends libdeflate-dev libisal-dev
+</sxh>
+===== Procédure =====
+  * Il faut aller chercher le code source sur GitHub:
+<sxh bash>
+% cd /opt/bio/sources
+% sudo curl -L -o fastp.0.24.1.tar.gz https://github.com/OpenGene/fastp/archive/refs/tags/v0.24.1.tar.gz
+% sudo tar -zxvf fastp.0.24.1.tar.gz
+% sudo rm -rf fastp.0.24.1.tar.gz
+</sxh>
+  * Il faut s'assurer que le répertoire ''fastp-0.24.1'' appartient à ''root'' avec les bonnes permissions:
+<sxh bash>
+% sudo chown -R root:root ./fastp-0.24.1
+% sudo chmod 755 ./fastp-0.24.1
+</sxh>
+  * On procède à la compilation grâce à la commande ''make''.
+<sxh bash>
+% cd fastp-0.24.1
+% sudo make
+</sxh>
+  * Pour accéder au programme, on modifie le fichier ''/etc/profile.d/impilo.sh'' pour y ajouter les lignes suivantes:
+<sxh bash>
+#
+# Fast specific environment variables
+#
+export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/fastp-0.24.1
+</sxh>