Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- fr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:imagej_2160 [2025/05/20 17:59] – [Procédure] foisys
+++ fr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:imagej_2160 [2025/05/20 18:01] (Version actuelle) – [Procédure] foisys
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+====== Installation de ImageJ 2.16 ======
+===== Librairies additionnelles =====
+  * Le fichier téléchargé vient avec son propre JRE, donc rien de plus à installer.
+===== Procédure =====
+**Note **: Fiji contient l'ensemble des librairies et modules compatibles pour ImageJ et il est possible que certains d'entres eux ne soient pas compatibles sous ''aarch64''…
+Voici la procédure suivi pour l'installation de ImageJ:
+  * Nouveauté: Fiji est l'application contenant ImageJ et avec presque tous les modules externes existants. Télécharger l'archive de Fiji à partir du site Web et décompresser la; vous obtiendrez un répertoire appelé Fiji.app
+<sxh bash>
+% cd /opt/bio/sources
+% sudo curl -L -O https://downloads.imagej.net/fiji/stable/fiji-stable-portable-nojava.zip
+% sudo unzip fiji-stable-portable-nojava.zip
+% sudo rm fiji-stable-portable-nojava.zip
+</sxh>
+  * Ce dossier devrait appartenir à ''root''. Les permissions de ce dossier devraient être ''755''.
+<sxh bash>
+% sudo chown -R root:root ./Fiji.app
+% sudo chmod 755 ./Fiji.app
+</sxh>
+  * ImageJ est démarré via dans un script shell portant le nom de ''fiji''; ce script s'occupe de l'auto-détection de la plateforme pour initialiser ImageJ.
+  * Finalement, éditer le fichier ''/etc/profile.d/impilo.sh''  en y ajoutant ces lignes à la toute fin du fichier:
+<sxh bash>
+#
+# ImageJ specific environment variable
+#
+export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/Fiji.app
+</sxh>
+  * ImageJ possède une fonction de mise à jour interne qui se trouve sous le menu **Help**. Pour réussir une mise à jour, il faut invoquer la commande ''fiji''  avec le ''sudo'':
+<sxh bash>
+# Juste faire ça la 1ere fois :-)
+% xhost si:localuser:root
+% sudo /opt/bio/sources/Fiji.app/fiji
+# Faites les mises à jour :-) </sxh>
+  * Pour ajouter ImageJ dans le menu des applications Impilo, il faut modifier le fichier de configuration de Xfce4:
+      * Plus à venir…