Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

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fr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:infernal_115 [2025/05/15 15:21] – [Installation de Infernal 1.1.4] foisysfr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:infernal_115 [2025/05/15 15:23] (Version actuelle) – [Procédure] foisys
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 +====== Installation de Infernal 1.1.5 ======
 +
 +===== Librairies additionnelles ===== 
 +
 +Aucune librairie additionnelle est nécessaires.
 +
 +===== Procédure =====
 +
 +Voici la procédure suivi pour l'installation Prodigal à partir du code source:
 +
 +  * Il faut aller chercher l'archive du code source et compiler l'application sous ''/opt/bio/sources'':
 +<sxh bash>
 +% cd /opt/bio/sources
 +% sudo curl -L -O http://eddylab.org/infernal/infernal-1.1.5.tar.gz
 +% sudo tar -zxvf infernal-1.1.5.tar.gz
 +% sudo rm -rf infernal-1.1.5.tar.gz
 +</sxh>
 +
 +  * Ce dossier devrait appartenir à ''root''. Les permissions de ce dossier devraient être ''755''.
 +<sxh bash>
 +% sudo chown -R root:root ./infernal-1.1.5
 +% sudo chmod -R 755 ./infernal-1.1.5
 +</sxh>
 +
 +  * Dès lors, la compilation se fait facilement:
 +<sxh bash>
 +% cd infernal-1.1.5
 +% sudo ./configure --prefix=`pwd` && sudo make && sudo make install
 +</sxh>
 +
 +  * Il faut finalement modifier le fichier ''/etc/profile.d/impilo.sh'' pour que la ligne de commande puisse trouver l'application en y ajoutant ces lignes:
 +<sxh bash>
 +#
 +# Infernal specific environment variables
 +#
 +export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/infernal-1.1.5/bin
 +</sxh>