Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- fr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:muscle_53 [2025/05/15 15:03] – [.Installation de MUSCLE 5.3] foisys
+++ fr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:muscle_53 [2025/05/15 15:03] (Version actuelle) – [.Librairies additionnelles] foisys
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+====== Installation de MUSCLE 5.3 ======
+===== Librairies additionnelles =====
+  * Aucune librairie additionnelle nécessaire si les librairies nécessaire pour la compilation sont installées.
+===== Procédure =====
+Voici la procédure suivi pour l'installation de MUSCLE à partir du code source:
+  * L'archive du code source a été téléchargé du site web et décompressé dans un dossier appelé ''muscle-5.3'':
+<sxh bash>
+% cd /opt/bio/sources
+% sudo curl -L -o muscle-5.3.tar.gz https://github.com/rcedgar/muscle/archive/refs/tags/v5.3.tar.gz
+% sudo tar -zxvf muscle-5.3.tar.gz
+% sudo rm -rf muscle-5.3.tar.gz
+</sxh>
+  * Ce dossier devrait appartenir à ''root''. Les permissions de ce dossier devraient être ''755''.
+<sxh bash>
+% sudo chown -R root:root ./muscle-5.3
+% sudo chmod 755 ./muscle-5.3
+</sxh>
+  * Une fois qu'on se retrouve dans le dossier ''/opt/bio/sources/muscle-5.3/src'', la compilation se fait simplement:
+<sxh bash>
+% cd muscle-5.3/src
+% sudo bash build_linux.bash
+</sxh>
+  * Finalement, ajouter ces lignes à la fin du fichier ''/etc/profile.d/impilo.sh''
+<sxh bash>
+#
+# MUSCLE specific environment variable
+#
+export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/muscle-5.3/bin
+</sxh>