Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- fr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:vienna_270 [2022/06/28 16:46] – créée - modification externe 127.0.0.1
+++ fr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:vienna_270 [2025/05/15 15:48] (Version actuelle) – foisys
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+====== Installation de ViennaRNA Package 2.7.0 ======
+===== Librairies additionnelles =====
+Aucune librairie supplémentaire n'est nécessaire pour cette installation.
+===== Procédure =====
+Voici la procédure suivi pour l'installation de ViennaRNA Package à partir du code source:
+    * L'archive du code source a été téléchargé du site web sous ''/opt/bio/sources/'' et décompressé.
+<sxh bash>
+% cd /opt/bio/sources
+% sudo curl -L -O https://www.tbi.univie.ac.at/RNA/download/sourcecode/2_7_x/ViennaRNA-2.7.0.tar.gz
+% sudo tar -zxvf ViennaRNA-2.7.0.tar.gz
+% sudo rm -rf ViennaRNA-2.7.0.tar.gz
+</sxh>
+    * Ce dossier devrait appartenir à ''root''. Les permissions de ce dossier devraient être ''755''.
+<sxh bash>
+% sudo chown -R root:root ./ViennaRNA-2.7.0
+% sudo chmod 755 ./ViennaRNA-2.7.0
+</sxh>
+    * Une fois qu'on se retrouve dans le dossier ''./ViennaRNA-2.7.0'', la compilation se fait simplement:
+<sxh bash>
+% cd ./ViennaRNA-2.7.0
+% sudo ./configure --prefix=`pwd` && sudo make && sudo make install
+</sxh>
+    * La commande ''sudo make install'' crée un répertoire ''/opt/bio/sources/ViennaRNA-2.7.0/bin'' qui contient les exécutables; il faut éditer le fichier ''/etc/profile.d/impilo.sh'' en y ajoutant ces lignes à la toute fin:
+<sxh bash>
+#
+# ViennaRNA Package specific environment variables
+#
+export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/ViennaRNA-2.7.0/bin
+</sxh>