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fr:install:bin_app_repository:sratoolkit [2025/05/15 16:12] – [Instructions d'installation] foisysfr:install:bin_app_repository:sratoolkit [2025/11/22 08:32] (Version actuelle) – [Instruction d'usage] foisys
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 +====== NCBI SRA Toolkit ======
  
 +===== Introduction =====
 +
 +La suite de logiciels SRA Toolit du NCBI permet d'obtenir les fichiers de la base de données //Sequence Read Archive// du NCBI et d'en extraire les fichiers sous diverses formes, incluant en format FASTQ. 
 +
 +===== Informations générales =====
 +
 +Site web: [[https://github.com/ncbi/sra-tools|https://github.com/ncbi/sra-tools]]
 +
 +License: [[https://spdx.org/licenses/NCBI-PD.html|NCBI Public Domain]] avec [[https://www.gnu.org/licenses/lgpl-3.0.en.html|GNU Lesser General Public License]] et inspiré par BSD pour certains fichiers permettant l'utilisations des fichiers en format VDB.
 +
 +===== Instructions d'installation =====
 +
 +^  Version Impilo  ^  Version installée  |
 +^ Impilo 24.04 A25  |  [[.:24_04_a25_build:sratoolkit_321|3.2.1]]  |
 +
 +===== Instruction d'usage =====
 +
 +  * Le [[https://github.com/ncbi/sra-tools/wiki|site wiki sur GitHub]] contient pas mal d'infos sur l'usage de la suite SRA Toolkit.
 +
 +===== Références =====
 +
 +  * À venir...