http://www.diploide.net/ 2026-05-31T03:38:35+00:00 http://www.diploide.net/ http://www.diploide.net/lib/exe/fetch.php?media=wiki:logo.png text/html 2026-05-29T20:09:15+00:00 foisys (foisys@undisclosed.example.com) http://www.diploide.net/doku.php?id=fr:install:vm_creation:vm_creation_adv:advanced_manual_part&rev=1780085355&do=diff Installation manuelle de disques virtuels afin d'augmenter votre espace de stockage Introduction * Avec une machine virtuelle, il n'est évidemment pas question de brancher des disques physiques! Cependant, on peut y ajouter des disques virtuels qui existent sur votre poste de travail sous la forme de fichiers qu'il faut ensuite utiliser comme des disques. text/html 2026-05-29T19:22:39+00:00 foisys (foisys@undisclosed.example.com) http://www.diploide.net/doku.php?id=fr:install:vm_creation:vm_creation_7&rev=1780082559&do=diff Construire une machine virtuelle Impilo pour biologistes sans expérience Installation d'Ubuntu 24.04 - Étapes finales de l'installation * L'installateur demande pour effacer notre unique partition pour faire l'installation (pour garder notre objectif de simplicité, nous n'irons pas dans le partitionnement manuel). text/html 2026-05-29T19:18:30+00:00 foisys (foisys@undisclosed.example.com) http://www.diploide.net/doku.php?image=fr%3Ainstall%3Avm_creation%3Axubuntu_7b_drives.png&ns=fr%3Ainstall%3Avm_creation&rev=1780082310&tab_details=history&media_do=diff&do=media <img src="http://www.diploide.net/lib/exe/fetch.php?w=500&amp;h=500&amp;tok=906e65&amp;media=fr:install:vm_creation:xubuntu_7b_drives.png" alt="xubuntu_7b_drives.png" loading="lazy" width="500" height="500" /> text/html 2026-05-29T19:18:01+00:00 foisys (foisys@undisclosed.example.com) http://www.diploide.net/doku.php?image=fr%3Ainstall%3Avm_creation%3Axubuntu_7a_drives.png&ns=fr%3Ainstall%3Avm_creation&rev=1780082281&tab_details=history&media_do=diff&do=media <img src="http://www.diploide.net/lib/exe/fetch.php?w=500&amp;h=500&amp;tok=4e2194&amp;media=fr:install:vm_creation:xubuntu_7a_drives.png" alt="xubuntu_7a_drives.png" loading="lazy" width="500" height="500" /> text/html 2026-05-29T14:55:28+00:00 foisys (foisys@undisclosed.example.com) http://www.diploide.net/doku.php?id=fr:install:vm_creation:vm_creation_main&rev=1780066528&do=diff Construire une machine virtuelle Impilo pour biologistes sans expérience Introduction * VirtualBox est un logiciel de création et de gestion de machines virtuelles; en date du mois de septembre 2024, la dernière version disponible est v. 7.1.0. Assurez-vous de télécharger également le text/html 2026-05-28T18:52:52+00:00 foisys (foisys@undisclosed.example.com) http://www.diploide.net/doku.php?id=fr:impilopedia:genex:rnaseq:airway_project:fetching_raw_data&rev=1779994372&do=diff Mise en pratique des méthodes d'analyse de l'expression génique grâce aux données utilisées par le package airway: obtenir les fichiers de séquence bruts du projet Introduction * Il faut maintenant se concentrer sur la méthodologie à employer pour optimiser l'automatisation des étapes. En construisant une hiérarchie unifiée pour les fichiers source, on pourra réutiliser cette hiérarchie dans les étapes de l'analyse. text/html 2026-05-06T20:02:17+00:00 foisys (foisys@undisclosed.example.com) http://www.diploide.net/doku.php?id=fr:install:bin_app_select&rev=1778097737&do=diff Processus d'installation des applications bio-informatiques retrouvées dans Impilo Impilo a comme but premier de rendre disponible sur un seul serveur le plus grand nombre possible d'applications en bio-informatique tout en associant ces applications à une documentation pertinente pour une utilisation optimale et pour l'enseignement. text/html 2026-04-30T20:45:52+00:00 foisys (foisys@undisclosed.example.com) http://www.diploide.net/doku.php?id=fr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:trnascan_2012&rev=1777581952&do=diff Installation de tRNAscan-SE 2.0.12 Librairies additionnelles Aucune librairie additionnelle est nécessaires. Cependant, il vous faudra avoir installer Infernal pour ne pas avoir d'erreur dans l'exécution... Procédure Voici la procédure suivi pour l'installation de tRNAscan-SE à partir du code source: text/html 2026-04-26T20:50:25+00:00 foisys (foisys@undisclosed.example.com) http://www.diploide.net/doku.php?id=fr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:sratoolkit_321&rev=1777236625&do=diff Instruction d'installation de SRA Tools 3.2.1 Librairies additionnelles Il faut installer la/les librairie(s) suivant(e)s: * flex * bison * cmake * doxygen * git * libxml2-dev Procédure Pour installer SRA Tools à partir du code source, il vous faut suivre la recette suivante: text/html 2026-04-23T21:37:21+00:00 foisys (foisys@undisclosed.example.com) http://www.diploide.net/doku.php?id=fr:impilopedia:genex:rnaseq:airway_project:index_creation_main&rev=1776980241&do=diff Mise en pratique des méthodes d'analyse de l'expression génique grâce aux données utilisées par le package airway: création des index nécessaires aux outils d'alignement Introduction * Ici, on va avoir notre première application de l'utilisation de SLURM text/html 2025-11-01T13:31:03+00:00 foisys (foisys@undisclosed.example.com) http://www.diploide.net/doku.php?image=wiki%3Alogo.png&ns=wiki&rev=1762003863&tab_details=history&media_do=diff&do=media <img src="http://www.diploide.net/lib/exe/fetch.php?w=500&amp;h=500&amp;tok=5f545a&amp;media=wiki:logo.png" alt="logo.png" loading="lazy" width="500" height="500" /> text/html 2025-02-10T15:55:53+00:00 foisys (foisys@undisclosed.example.com) http://www.diploide.net/doku.php?image=fr%3Ainstall%3Avm_creation%3Axubuntu_12_end.png&ns=fr%3Ainstall%3Avm_creation&rev=1739202953&tab_details=history&media_do=diff&do=media <img src="http://www.diploide.net/lib/exe/fetch.php?w=500&amp;h=500&amp;tok=cf746b&amp;media=fr:install:vm_creation:xubuntu_12_end.png" alt="xubuntu_12_end.png" loading="lazy" width="500" height="500" /> text/html 2024-10-10T19:21:47+00:00 foisys (foisys@undisclosed.example.com) http://www.diploide.net/doku.php?image=fr%3Ainstall%3Avm_creation%3Axubuntu_4_interactif.png&ns=fr%3Ainstall%3Avm_creation&rev=1728588107&tab_details=history&media_do=diff&do=media <img src="http://www.diploide.net/lib/exe/fetch.php?w=500&amp;h=500&amp;tok=15279a&amp;media=fr:install:vm_creation:xubuntu_4_interactif.png" alt="xubuntu_4_interactif.png" loading="lazy" width="500" height="500" /> text/html 2024-10-10T19:21:47+00:00 foisys (foisys@undisclosed.example.com) http://www.diploide.net/doku.php?image=fr%3Ainstall%3Avm_creation%3Axubuntu_3_internet.png&ns=fr%3Ainstall%3Avm_creation&rev=1728588107&tab_details=history&media_do=diff&do=media <img src="http://www.diploide.net/lib/exe/fetch.php?w=500&amp;h=500&amp;tok=7dd985&amp;media=fr:install:vm_creation:xubuntu_3_internet.png" alt="xubuntu_3_internet.png" loading="lazy" width="500" height="500" /> text/html 2024-10-10T19:21:47+00:00 foisys (foisys@undisclosed.example.com) 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